http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/news-5-1-12.html
Segundo nota em: http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/news-5-1-12.html
“O suporte à engine BerkeleyDB (BDB) foi eliminado dessa versão. Quaisquer tabelas existentes que estejam no formato BDB não serão legíveis pelo MySQL 5.1.12 ou superiores. Você deve conveterr suas tabelas para outra engine antes de atualizar para o to 5.1.12.”
O BerkeleyDB foi, durante muito tempo, o único engine transacional para o MySQL. Há pouco tempo atrás, a Sleepycat (criadora do BDB) foi comprada pela Oracle.
Será que a MySQL AB planeja retirar o suporte ao InnoDB (atualmente, a engine transacional mais usada no MySQL)? Pouco provável, até mesmo pq o InnoDB é GPL.
Será que o Falcon (engine criada por Jim Starkey, ex-Interbase e ex-Firebird) será lançada em breve?
Alguns links sobre o tema: